Graficzny znak szkoły powstał w 1999 roku. Autorem logo jest Mirosław Donarski, wówczas nauczyciel informatyki, dziś dyrektor szkoły. Praca została wyłoniona w konkursie adresowanym do uczniów, nauczycieli i rodziców.
Symbolika:
Logo przedstawia oliwną lampkę - kaganek tlący się trzema stylizowanymi płomieniami na granatowym tle w kształcie koła. W otoku umieszczony jest napis białą czcionką: u góry - SZKOŁA PODSTAWOWA IM. JANA PAWŁA II, na dole - W ŁOCHOWIE. Kaganek to symbol oświaty, nauki, szerzenia wiedzy. Kolory płomieni: żółty, biały i czerwony nawiązują odpowiednio do barw papieskich i narodowych.
W roku powstania logo, napis u góry brzmiał: ZESPÓŁ SZKÓŁ IM. JANA PAWŁA II W ŁOCHOWIE. Trzy płomienie kaganka symbolizowały: oddziały przedszkolne, szkołę podstawową i gimnazjum. W związku z reformą oświaty w 2017 roku zmieniony został górny napis.